ABSTRACT The safflower is an oleaginous plant belonging to the Asteraceae family. It is used as a raw material for various purposes. These plants are popular for the quality and quantity of oil produced and, and thus, studying their genetic variability using markers is necessary for determining genetic resources to conduct breeding programs. Therefore, we evaluated the genetic variability of safflower genotypes using Simple Sequence Repeat (SSR) molecular markers. The study was conducted at the State University of Mato Grosso “Carlos Alberto Reyes Maldonado”, in the Campus of Cáceres-MT. In total, 121 safflower genotypes from the Germplasm collection were evaluated using 21 SSR markers. The programs GenAlEx 6.5, GENES, and Structure were used to analyze the data. We identified 158 alleles at 21 loci among the genotypes. The expected heterozygosity (He) was high (0.551 - 0.804), but the observed heterozygosity (Ho) was low (0.000 - 0.502), and the indices of the endogamy coefficient (F) were positive in all loci and all populations, with an overall average of 0.958. The genetic differentiation (FST) values among populations were low, with an average of 0.010, which suggested a low population structure. The modified Tocher clustering and the UPGMA hierarchical clustering yielded 19 and 15 distinct groups, respectively. The genetic structure showed two populations, with few intermixes in the genome. The evaluated safflower genotypes showed genetic variability, and these genetically different variants might be used in breeding programs to obtain cultivars adapted to Brazil.

RESUMO O cártamo é uma oleaginosa da família Asteraceae, cuja matéria-prima serve para diversos fins. A cultura se destaca pela qualidade e quantidade de óleo produzido, neste sentido o estudo da variabilidade genética com o uso de marcadores é uma etapa inicial na exploração dos recursos genéticos em um programa de melhoramento. Diante disso, estimou-se a variabilidade genética de genótipos de cártamo via marcadores moleculares Simple Sequence Repetition (SSR). O estudo foi conduzido na Universidade Estadual de Mato Grosso “Carlos Alberto Reyes Maldonado”, Campus de Cáceres-MT, onde foram avaliados 121 genótipos de cártamo da coleção de Germoplasma, utilizando 21 marcadores SSR. Foram utilizados os programas GenAlEx 6.5, GENES e software Structure para os respectivos resultados. O número de alelos detectados entre os genótipos considerando os 21 loci foi de 158, a He pode ser considerada alta, variando de 0,551 a 0,804, já a heterozigosidade observada (Ho) foi baixa, variando de 0,000 a 0,502, e índices de coeficiente de endogamia (F) foram positivos em todos os locus e em todas as populações, possuindo uma média geral de 0,958. Os valores de medida de diferenciação genética (FST) entre as populações foram encontrados baixos em média de 0,010, sugerindo baixa estrutura populacional. O agrupamento de Tocher modificado obteve 19 grupos, e o agrupamento hierárquico de UPGMA 15 grupos distintos. A estruturação genética demostrou duas populações, com poucas intermixagem no genoma. Os genótipos de cártamo avaliados possuem variabilidade genética, sendo possível explorar esta variabilidade em um programa de melhoramento genético visando obter cultivares adaptados ao Brasil.

ABSTRACT The common bean, a legume of significant economic importance, is renowned for its extensive genetic variability. It is crucial to comprehend genetic diversity, analyze population structure, and understand relationships among commercial classes of accessions to facilitate genetic improvement. This study aimed to molecularly characterize 143 common bean accessions by employing 25 SSR molecular markers. The objectives were to estimate genetic diversity, analyze genetic structure, and cluster populations using the UPGMA and PCoA methods. A total of 105 alleles were amplified using microsatellite loci, and the observed heterozygosity was lower than expected across all loci, indicating inbreeding within the populations. Among the loci, 22 were highly informative, demonstrating their effectiveness and polymorphism in detecting genetic diversity. The genetic variability within the population was found to be the highest, while variation between populations was the lowest. The analysis of population structure revealed the presence of three populations with a notable rate of gene introgression. The UPGMA analysis categorized the accessions into 15 groups, but they did not form distinct clusters based on their geographic regions or gene pool. The first two principal coordinates accounted for 13.95% of the total variation among the accessions. The SSR markers employed effectively detected genetic variability among the common bean accessions, revealing that their genetic diversity was not correlated with their geographic distribution in this study.

RESUMO O feijão comum é uma das leguminosas de importância econômica e conhecida por sua ampla variabilidade genética. O conhecimento da diversidade genética, a análise da estrutura populacional e o entendimento das relações dentro e entre as classes comerciais a partir dos acessos são passos essenciais no melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular de 143 acessos de feijoeiro usando 25 marcadores moleculares SSR para estimativa da diversidade genética, análise da estrutura genética e agrupamento das populações pelos métodos UPGMA e PCoA. Um total de 105 alelos foram amplificados usando loci microssatélites, e a heterozigosidade observada foi menor do que a esperada em todos os loci. O índice de fixação indicou endogamia dentro das populações. Dentre os locos, 22 foram considerados altamente informativos, mostrando-se eficazes e polimórficos na detecção da diversidade genética. A maior variabilidade genética observada dentro das populações, enquanto a menor variação entre as populações. A análise da estrutura populacional mostrou a presença de três populações, entre as quais foi observada uma alta taxa de introgressão de genes. A análise UPGMA permitiu a divisão dos acessos em 15 grupos, mas os acessos não formaram grupos distintos de acordo com suas regiões geográficas ou pool gênico. As duas primeiras coordenadas principais explicaram 13,95% da variação total entre os acessos. Os marcadores SSR utilizados mostraram-se eficientes em detectar a variabilidade genética entre os acessos, cuja diversidade genética demonstrou que a distribuição geográfica neste estudo não esteve relacionada à distância genética entre eles.

RESUMO. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar isolados de C. lindemuthianum da raça 65 provenientes de diversas regiões do Brasil, por meio de sequenciamento de regiões ITS. Um total de 17 isolados da raça 65, coletados nos estados do Mato Grosso, Minas Gerais, Paraná, Santa Catarina e São Paulo, foram estudados. As análises das sequências dos isolados 8, 9, 12, 14 e 15 revelaram a presença de dois SNPs na região ITS1 nas mesmas posições. Estes mesmos isolados quando analisados juntamente com a sequência do isolado 17 apresentaram um SNP na região ITS2. A maior dissimilaridade genética foi de 0,772 observada entre os isolados 11 e 3 e entre os isolados 11 e 10. Por sua vez, os isolados 7 e 2 foram os mais similares, com valor de distância genética de 0,002. A árvore filogenética obtida com base nas sequências das regiões ITS1 e ITS2 revelou a formação de dois grupos, sendo um com a divisão de um subgrupo. Estes resultados revelam uma elevada variabilidade molecular entre isolados da raça 65 de C. lindemuthianum.

ABSTRACT. The present work aimed characterize isolates of C. lindemuthianum race 65 from different regions in Brazil by ITS sequencing. A total of 17 isolates of race 65, collected in the states of Mato Grosso, Minas Gerais, Paraná, Santa Catarina and São Paulo, were studied. Analysis of the sequences of isolates 8, 9, 12, 14 and 15 revealed the presence of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the ITS1 region at the same positions. These isolates, when analyzed together with the sequence of isolate 17, revealed a SNP in the ITS2 region. The highest genetic dissimilarity, observed between isolates 11 and 3 and between isolates 11 and 10, was 0.772. In turn, isolates 7 and 2 were the most similar, with a value of 0.002 for genetic distance. The phylogenetic tree obtained based on the sequences of the ITS1 and ITS2 regions revealed the formation of two groups, one with a subgroup. The results reveal high molecular variability among isolates of race 65 of C. lindemuthianum.